病理科是医院的核心诊断平台科室之一，病理医师被誉为临床医学的“法官”，而病理诊断则是疾病诊断的“金标准”。本科室是玉环市病理质控学组和玉环市人民医院健共体集团病理诊断中心的承接单位。科室现有医技人员共14名，拥有高级、中级、初级等不同职称梯队，具备扎实的病理诊断能力及多学科协作经验，涵盖肿瘤病理、非肿瘤病理、细胞病理及分子病理等亚专业方向。科室严格按照三级医院标准建设，拥有1000平米工作空间，拥有进口冰冻切片机、全自动脱水机、包埋机以及染封一体机、全自动免疫组化机，多套显微镜等先进仪器。目前科室已开展组织病理学检查、细胞病理学检查、术中快速冰冻病理以及免疫组化与分子检测等项目。科室通过显微镜观察组织、细胞及分子层面的病理变化，结合先进技术手段，为临床提供精准的疾病诊断依据，指导治疗方案制定及预后评估。2017年开始与温州医科大学附属第一医院病理科进行实质性合作，每周均有专家来科室参与诊断工作和带教工作。2019年成为浙江省病理专科联盟成员（省肿瘤主导），2019年成为临床病理专科联盟成员单位（浙一医院主导）。